Dizemos que o sistema cartesiano é "natural" em razão da topologia e geometria da reta real: as coordenadas cartesianas são simplesmente compostas por trincas ordenadas das coordenadas da reta real. Escolher as coordenadas da reta real é uma tarefa que envolve apenas a especificação do ponto zero, ou seja, da origem da reta. Uma vez que a estrutura gráfica de \(\mathbb{R}^3\) é a da interseção de três retas reais perpendiculares entre si, estabelecer a origem é a única preocupação.
Contudo, podemos utilizar outros sistemas de coordenadas para representar posições em \(\mathbb{R}^3\). São os casos, por exemplo, das coordenadas esférico-polares (fig. \ref{633067}).