Repeat type Characteristics of SSR A. denticulata A. podophylla A. gigantea A. metteniana A. costularis A. spinulosa S. brunoniana S. lepifera
Mononucleotide No. of SSRs 40 47 41 40 95 96 77 80
Abundance (No./kb) 0.26 0.28 0.25 0.25 0.61 0.61 0.49 0.49
Density (bp/kb) 2.93 3.16 3.13 2.88 7.67 7.60 6.41 6.31
GC 0.36 0.35 0.40 0.3 0.22 0.19 0.08 0.09
Dinucleotide No. of SSRs 8 9 10 10 14 14 15 11
Abundance (No./kb) 0.05 0.05 0.06 0.06 0.09 0.09 0.10 0.07
Density (bp/kb) 0.69 0.83 0.94 0.92 1.35 1.35 1.40 1.04
GC 0.06 0 0.08 0.05 0 0 0.23 0.12
Trinucleotide No. of SSRs 2 1 2 2 1 1 0 0
Abundance (No./kb) 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0 0
Density (bp/kb) 0.16 0.07 0.15 0.15 0.08 0.08 0 0
GC 0 0 0 0 0.33 0.33 0 0
Tetranucleotide No. of SSRs 10 9 11 12 11 11 10 11
Abundance (No./kb) 0.80 0.05 0.07 0.07 0.07 0.07 0.06 0.07
Density (bp/kb) 0.14 0.67 0.84 0.92 0.87 0.87 0.82 0.84
GC 0.18 0.14 0.18 0.16 0.29 0.29 0.3 0.23
Pentanucleotide No. of SSRs 1 1 0 1 0 0 0 0
Abundance (No./kb) 0.01 0.01 0 0.01 0 0 0 0
Density (bp/kb) 0.10 0.09 0 0.09 0 0 0 0
GC 0 0.4 0 0.4 0 0 0 0