REFERENCES
  1. M. P. Stumpf, T. Thorne, E. de Silva, R. Stewart, H. J. An, M. Lappe, C. Wiuf, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008 , 105, 6959.
  2. D. V. Arkhipov, S. N. Lomin, Y. A. Myakushina, E. M. Savelieva, D. I. Osolodkin, G. A. Romanov, Int. J. Mol. Sci. 2019 , 20, 2096.
  3. C. Reynès, H. Host, A. C. Camproux, G. Laconde, F. Leroux, A. Mazars, B. Deprez, R. Fahraeus, B. O. Villoutreix, O. Sperandio, PLoS Comput. Biol. 2010 , 6, e1000695.
  4. R. Sable, S. Jois, Molecules 2015 , 20, 11569.
  5. M. A. Kuenemann, O. Sperandio, C. M. Labbé, D. Lagorce, M. A. Miteva, B. O. Villoutreix, Prog. Biophys. Mol. Bio. 2015 , 119, 20.
  6. L. G. Ferreira, G. Oliva, A. D. Andricopulo, Expert Opin. Drug Dis.2016 , 11, 957.
  7. W. H. Shin, C. W. Christoffer, D. Kihara, Methods 2017 , 131, 22.
  8. D. Lagorce, D. Douguet, M. A. Miteva, B. O. Villoutreix, Sci. Rep.2017 , 7, 46277.
  9. Y. Yagi, Y. Naoshima, Transaction of the Japan Society for Simulation Technology, 2012 , 4, 127.
  10. S. Jakobsen, K. Kristensen, F. Jensen, J. Chem. Theory Comput.2013 , 9, 3978.
  11. J. M. H. Olsen, N. H. List, K. Kristensen, J. Kongsted, J Chem. Theory Comput. 2015, 11, 1832.
  12. K. Kitaura, T. Sawai, T. Asada, T. Nakano, M. Uebayasi, Chem. Phys. Lett. 1999 , 312, 319.
  13. D. G. Fedorov, K. Kitaura, J. Phys. Chem. A 2007 , 111, 6904.
  14. T. Nakano, T. Kaminuma, T. Sato, K. Fukuzawa, Y. Akiyama, M. Uebayasi, K. Kitaura, Chem. Phys. Lett. 2002 , 351, 475.
  15. Y. Mochizuki, S. Koikegami, T. Nakano, S. Amari, K. Kitaura, Chem. Phys. Lett. 2004 , 396, 473.
  16. D. G. Fedorov, K. Kitaura, J. Chem. Phys. 2004 , 121, 2483.
  17. Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Koikegami, S. Tanimori, Y. Abe, U. Nagashima, K. Kitaura, Theor. Chem. Acc. 2004 , 112, 442.
  18. Y. Mochizuki, T. Nakano, Y. Komeiji, K. Yamashita, Y. Okiyama, H. Yoshikawa, H. Yamataka, Chem. Phys. Lett. 2011 , 504, 95.
  19. T. Nagata, D. G. Fedorov, K. Ishimura, K. Kitaura, J. Chem. Phys.2011 , 135, 044110.
  20. Y. Mochizuki, K. Yamashita, K. Fukuzawa, K. Takematsu, H. Watanabe, N. Taguchi, Y. Okiyama, M. Tsuboi, T. Nakano, S. Tanaka, Chem. Phys. Lett. 2010 , 493, 346.
  21. H. Yamada, Y. Mochizuki, K. Fukuzawa, Y. Okiyama, Y. Komeiji, Comput. Theor. Chem. 2017 , 1101, 46.
  22. T. Ishikawa, K. Kuwata, Chem. Phys. Lett. 2009 , 474, 195.
  23. M. Katouda, Theor. Chem. Acc. 2011 , 130, 449.
  24. T. Ishikawa, K. Kuwata, J. Phys. Chem. Lett. 2012 , 3, 375.
  25. T. Ishikawa, K. Sakakura, Y. Mochizuki, J. Comput. Chem.2018 , 39, 1970.
  26. T. Ishikawa, Y. Mochizuki, S. Amari, T. Nakano, H. Tokiwa, S. Tanaka, K. Tanaka, Theor. Chem. Acc. 2007 , 118, 937.
  27. T. Ishikawa, Y. Mochizuki, S. Amari, T. Nakano, S. Tanaka, K. Tanaka, Chem. Phys. Lett. 2008 , 463, 189.
  28. D. G. Fedorov, K. Kitaura, J. Chem. Phys. 2005 , 123, 134103.
  29. Y. Mochizuki, K. Yamashita, T. Nakano, Y. Okiyama, K. Fukuzawa, N. Taguchi, S. Tanaka, Theor. Chem. Acc. 2011 , 130, 515.
  30. Y. Okiyama, H. Watanabe, K. Fukuzawa, T. Nakano, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, S. Tanaka, K. Ebina, Chem. Phys. Lett. 2007 , 449, 329.
  31. Y. Okiyama, H. Watanabe, K. Fukuzawa, T. Nakano, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, K. Ebina, S. Tanaka, Chem. Phys. Lett. 2009 , 467, 417.
  32. L. Chang, T. Ishikawa, K. Kuwata, S. Takada, J. Comput. Chem.2013 , 34, 1251.
  33. T. Ishikawa, Int. J. Quantum Chem. 2018 , 118, e25535.
  34. D. G. Fedorov, A. Brekhov, V. Mironov, Y. Alexeev, J. Phys. Chem. A2019 , 123, 6281.
  35. R. S. Herbst, J. C. Soria, M. Kowanetz, G. D. Fine, O. Hamid, M. S. Gordon, J. A. Sosman, D. F. McDermott, J. D. Powderly, S. N. Gettinger, H. E. K. Kohrt, L. Horn, D. P. Lawrence, S. Rost, M. Leabman, Y. Xiao, A. Mokatrin, H. Koeppen, P. S. Hegde, I. Mellman, D. S. Chen, F. S. Hodi, Nature 2014 , 515, 563.
  36. T. N. Schumacher, C. Kesmir, M. M. van Buuren, Cancer cell2015 , 27, 12.
  37. H. Lim, J. Chun, X. Jin, J. Kim, J. Yoon, K. T. No, Investigation of protein-protein interactions and hot spot region between PD-1 and PD-L1 by fragment molecular orbital method. Sci. Rep.2019 , 9, 1.
  38. T. Ishikawa, N. Yamamoto, K. Kuwata, Chem. Phys. Lett. 2010 , 500, 149.
  39. T. Ishikawa, T. Ishikura, K. Kuwata, J. Comput. Chem. 2009 , 30, 2594.
  40. E. F. Pettersen, T. D. Goddard, C. C. Huang, G. S. Couch, D. M. Greenblatt, E. C. Meng, T. E. Ferrin, J. Comput. Chem. 2004 , 25, 1605.
  41. K. M. Zak, R. Kitel, S. Przetocka, P. Golik, K. Guzik, B. Musielak, A. Domling, G. Dubin, T. A. Holak, Structure 2015 , 23, 2341.
  42. V. Hornak, R. Abel, A. Okur, B. Strockbine, A. Roitberg, C. Simmerling, Proteins 2006 , 65, 712.
  43. D. A. Case, T. A. Darden, T. E. Cheatham III, C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, M. Crowley, R. C. Walker, W. Zhang, K. M. Merz Jr, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, I. Kolossvary, K. F. Wong, F. Paesani, J. Vanicek, X. Wu, S. R. Brozell, I. Steinbrecher, H. Gohlke, L. Yang, C. Tan, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, D. H. Mathews, M. G. Seetin, C. Sagui, V. Babin, P. A. Kollman, AMBER 10 2008 , San Francisco, University of California.
  44. T. H. Dunning Jr, J. Chem. Phys. 1989 , 90, 1007.
  45. F. Weigend, A. Kohn, C. Hattig, J. Chem. Phys. 2002 , 116, 3175.